Na mestu izgradnje manastira se nalazilo pagansko i hrišćansko svetilište još u periodu antike. Manastirska crkva je trikohalna građevina sa malom pripratom na zapadnoj strani. Svod crkve oslanja se na bočne lukove ojačane velikim pilastrima. Pod crkve popločan je klesanim kamenim pločama. Prva obnova građevine je izvršena krajem 16. veka, dok je početkom 17. veka izrađen deo ikonostasa.
U vreme mitropolita Kalinika (1835) su obnovljeni prozori, fasade, podne površine i portal. Putujuće zografsko udruženje je 1869. godine oslikalo novi ikonostas koji odiše duhom tog vremena. Tada je oslikano 46 ikona i urađen je duborezni ikonostas sa biljnim ornamentima. U crkvi se nalazi ikona Svetog Jovana za koju se misli da ima lekovito dejstvo. Ruske monahinje koje su pobegle tokom Oktobarske revolucije su u Manastiru Svetog Jovana osnovale školu za slepe.
Manastir je dobro posećen cele godine i najviše pažnje privlače:
Ikona Svetog Jovana Krstitelja: veruje se da je plakala tokom bombardovanja 1999. godine
Dodaj rezenciju